中南大学计算机学院、生物信息学湖南省重点实验室成员赵其昌博士和杨梦云博士在药物-蛋白质关系预测领域取得重要研究成果。该研究成果以“Biomedical data and deep learning computational models for predicting compound-protein relations”为题，在国际生物信息学期刊《IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics》(IF=3.015)以论文形式在线发表。
药物开发是当前生物医学领域的关键问题和挑战。识别药物与蛋白质之间的关系对药物开发至关重要。近年来，随着生物高通量技术和虚拟筛选技术的发展，产生了大量的生物活性数据，使基于深度学习的药物-蛋白质关系预测方法得到快速发展。该研究成果概述了药物，蛋白质与药物-蛋白质关系的相关数据库，从药物与蛋白质的特征提取以及计算模型两个方面总结了基于深度学习的药物-蛋白质关系预测方法，并通过交叉验证实验对一些具有代表性的方法进行了对比与总结，并对未来工作提出了展望和讨论。
王建新教授团队长期致力于计算机算法与优化、生物信息学、医学影像分析等方面研究。该研究工作得到国家自然科学、高等学校学科创新引智计划、湖南省科技计划等基金支持。
基于深度学习的药物-蛋白质关系预测流程图