• 首页
  • 实验室概况
    • 实验室介绍
    • 实验室管理
    • 学术委员会
    • 实验室组成
    • 规章制度
  • 科学研究
    • 研究方向
    • 研究进展
    • 学术论文
    • 科研项目
  • 研究队伍
    • 序列分析
    • 生物网络分析
    • 医学影像分析
    • 生物数据挖掘
  • 研究生教育
    • 招生指南
    • 导师信息
    • 活动展示
  • 合作交流
    • 学术会议
    • 学术报告
  • 开放课题
    • 通知
    • 申请指南
    • 管理办法
    • 经费细则
    • 申请表格
  • 新闻中心
    • 资讯动态
    • 新闻公告
  • 开源软件
  • 联系我们
当前位置: 首页 >> 科学研究 >> 研究进展 >> 正文

CLPred:一种新的蛋白质结晶预测工具

2020年09月05日 18:10  点击:[]


中南大学计算机学院、生物信息学湖南省重点实验室成员在蛋白质结晶预测研究领域取得重要研究成果。该研究成果以“CLPred: A sequence-based protein crystallization predictor using BLSTM neural network”为题,被生物信息学领域Top会议《European Conference on Computational Biology》录用,该会议论文将直接在期刊《Bioinformatics》(IF=5.610)上在线发表。中南大学计算机学院、生物信息学湖南省重点实验室研究生宣文静为论文的第一作者,王建新教授和黎耀航教授为通讯作者,中南大学为第一通讯单位。



基于晶体学的X射线衍射技术是测定蛋白质结构的主要实验方法,是了解蛋白质生物学功能的关键。然而,获得晶体的实验过程是昂贵和费时的,并且有较高的损耗率。因此,在进行晶体实验之前首先通过计算方法筛选出具有较高结晶倾向的蛋白质,将大大降低蛋白质结构分析的成本。该研究成果仅使用原始蛋白质序列,通过具有长短期记忆的双向循环神经网络来有效地捕获氨基酸之间的高阶、远距离相互作用模式,在多个数据集上预测的准确度得到提高,并证实其具有实际的生物指导意义。

王建新教授团队长期致力于计算机算法与优化、生物信息学、大数据应用等方面研究。该研究工作得到国家自然科学、湖南省科技计划和NSFC-浙江省两化融合联合等基金支持。


Model.png

 CLPred模型架构图



上一条:基于深度矩阵分解的环状RNA与疾病关联关系预测方法
下一条:微生物与疾病关联预测的综述发表

【关闭】

版权所有 生物信息学湖南省重点实验室 Copyright ©2020 http://bio.csu.edu.cn/

湖南省长沙市岳麓区麓山南路932号, 410083 电话/传真:(0731)- 88830212 电子邮件:hunan_bio@csu.edu.cn